El programa científico, en un proceso continuo de construcción, es resultado de discusiones intensivas entre los colaboradores bilaterales IDEA y ZEF. Todas las iniciativas y actividades dentro del programa se relacionan con los siguientes objetivos:

1) Exploración de las complejas relaciones entre el conflicto (incluyendo el acuerdo de paz) y el ambiente en sus diferentes manifestaciones, considerando los bienes naturales como la razón, la víctima y finalmente la solución para los conflictos.

2) El análisis de los actores e instituciones competentes en diversas escalas en el manejo de la tierra, profundizando en la comprensión del marco institucional y socioeconómico requerido tanto para el uso sostenible de la tierra, como para la sustentabilidad de los ecosistemas.

3) El análisis de las dependencias e interdependencias de factores sociales, simbólicos (legales), tecnológicos, políticos y económicos que fomentan la inequidad en el acceso a la tierra y los derechos territoriales en Colombia.

4) El análisis del potencial de fortalecimiento de las comunidades en sus actividades de uso y protección del ambiente.